原理——DNA的半保留复制
DNA 在进行复制的时候链间氢键断裂,双链解旋分开,每条链作为模板在其上合成互补链,经过一系列酶的作用生成两个新的DNA分子。
变性:模板DNA在95℃高温下变性,双链打开变成单链。
退火:被称为引物的短DNA分子与目标DNA的侧翼区域结
延伸:模板DNA-引物结合物在Taq DNA聚合酶的作用下,以dNTP为原料,靶序列为模板,按碱基互补配对原则和半保留复制原理,引物沿着5'→3'的方向合成新的DNA链。
PCR体系
PCR模板DNA
PCR模板可以是任何DNA来源,如基因组DNA(gDNA)、互补DNA(cDNA)和质粒DNA。不过,DNA的组成或复杂度会影响PCR扩增的最佳起始量。最佳模板起始量还取决于所使用的 DNA 聚合酶类型,所需的DNA起始量更少。对DNA起始量的优化很重要,因为起始量过高会增加发生非特异性扩增的风险,
tp钱包官网而起始量过低会降低得率。
引物
Primers(引物)是含有15-30个碱基的合成DNA寡核苷酸。能够与模板DNA中目标区域的侧翼序列结合(通过碱基互补配对)。在PCR反应期间,DNA聚合酶从 3′端开始延伸引物。因此,引物结合位点必须是靶标附近所特有的,并且与起始DNA的其它部分序列具有最小的同源性,以确保目的片段的特异性扩增。
dNTPs
dNTPs(核苷酸)由四个基本核苷酸组成。
缓冲体系
PCR buffer能够为DNA聚合酶活性提供适宜的化学环境。缓冲液pH通常为8.0-9.5,一般使用Tris-HCl来调节。镁离子作为DNA聚合酶活性的辅助因子,有助于聚合期间dNTP的结合。酶活性位点处的镁离子可催化引物的3′-OH与dNTP的磷酸基团间形成磷酸二酯键。此外, Mg2+ 能够稳定磷酸盐骨架上的负电荷,从而促进引物与DNA模板形成复合物。缓冲液的一个常见成分是来自KCl的钾离子,其可促进引物的吸附。也可使用硫酸铵(NH4)2SO4 代替KCl。铵离子(NH4+) 具有去稳定作用,尤其对于错配引物-模板复合物碱基对之间的弱氢键,因此可增强反应特异性。
PCR实验操作
1.在进行基因克隆或者载体构建的实验中我们使用高保真DNA聚合酶
2.按照说明书准备高保真酶mix、DNA模板、引物、双蒸水
3.查看引物单信息,核对引物浓度和Tm值
研究生 pcr引物设计 研究生日常 pcr引物 pcr实验